Specialista v oblastech monitorování vysokorychlostních sítí a síťové bezpečnosti. Již přes 10 let pracuje ve sdružení CESNET a v současné době působí jako vedoucí výzkumný pracovník, tzn. vedoucí týmu výzkumníků a vývojářů, manažer výzkumných projektů a konzultant. Mezi jeho další aktivity patří vzdělávání a vedení studentů (včetně doktorandů) jako odborný asistent na Fakultě informačních technologií ČVUT v Praze. Studenti FIT ČVUT se sdružují pod Laboratoří monitorování síťového provozu, jejímž zakladatelem je právě Tomáš Čejka. V neposlední řadě je Tomáš Čejka zapojený i do výuky a výzkumu v oblasti síťové bezpečnosti a (hardwarově akcelerovaného) monitorování síťového provozu.